Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERV-K104P61576 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms