Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EEFSECP57772 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms