Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHB3P54753 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms