Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPAP53621 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPAP53621 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPAP53621 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPAP53621 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPAP53621 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPAP53621 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPAP53621 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPAP53621 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPAP53621 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPAP53621 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPAP53621 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPAP53621 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPAP53621 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
COPAP53621 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPAP53621 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPAP53621 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPAP53621 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPAP53621 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPAP53621 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPAP53621 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPAP53621 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPAP53621 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPAP53621 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPAP53621 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPAP53621 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPAP53621 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPAP53621 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPAP53621 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPAP53621 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPAP53621 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COPAP53621 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COPAP53621 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPAP53621 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPAP53621 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPAP53621 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPAP53621 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPAP53621 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPAP53621 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPAP53621 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPAP53621 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPAP53621 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COPAP53621 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPAP53621 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPAP53621 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPAP53621 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPAP53621 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPAP53621 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPAP53621 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPAP53621 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPAP53621 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COPAP53621 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPAP53621 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPAP53621 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPAP53621 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPAP53621 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPAP53621 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPAP53621 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPAP53621 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPAP53621 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPAP53621 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPAP53621 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPAP53621 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPAP53621 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPAP53621 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPAP53621 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPAP53621 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPAP53621 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
COPAP53621 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPAP53621 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPAP53621 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPAP53621 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPAP53621 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPAP53621 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPAP53621 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPAP53621 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPAP53621 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPAP53621 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COPAP53621 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPAP53621 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPAP53621 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COPAP53621 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPAP53621 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COPAP53621 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COPAP53621 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPAP53621 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPAP53621 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPAP53621 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COPAP53621 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COPAP53621 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COPAP53621 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COPAP53621 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COPAP53621 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COPAP53621 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COPAP53621 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COPAP53621 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPAP53621 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPAP53621 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPAP53621 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPAP53621 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms