Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DAP3P51398 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DAP3P51398 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DAP3P51398 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DAP3P51398 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DAP3P51398 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
DAP3P51398 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DAP3P51398 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DAP3P51398 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DAP3P51398 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DAP3P51398 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DAP3P51398 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DAP3P51398 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DAP3P51398 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DAP3P51398 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DAP3P51398 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DAP3P51398 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DAP3P51398 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DAP3P51398 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DAP3P51398 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DAP3P51398 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DAP3P51398 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DAP3P51398 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DAP3P51398 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DAP3P51398 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DAP3P51398 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DAP3P51398 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DAP3P51398 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DAP3P51398 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DAP3P51398 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DAP3P51398 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DAP3P51398 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DAP3P51398 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DAP3P51398 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DAP3P51398 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DAP3P51398 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DAP3P51398 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DAP3P51398 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DAP3P51398 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DAP3P51398 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DAP3P51398 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DAP3P51398 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DAP3P51398 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DAP3P51398 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DAP3P51398 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DAP3P51398 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DAP3P51398 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DAP3P51398 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DAP3P51398 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DAP3P51398 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DAP3P51398 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DAP3P51398 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DAP3P51398 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DAP3P51398 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DAP3P51398 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DAP3P51398 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DAP3P51398 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DAP3P51398 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DAP3P51398 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DAP3P51398 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DAP3P51398 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DAP3P51398 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DAP3P51398 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DAP3P51398 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DAP3P51398 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DAP3P51398 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DAP3P51398 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DAP3P51398 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DAP3P51398 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DAP3P51398 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DAP3P51398 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DAP3P51398 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DAP3P51398 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DAP3P51398 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DAP3P51398 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DAP3P51398 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DAP3P51398 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DAP3P51398 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DAP3P51398 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DAP3P51398 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DAP3P51398 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DAP3P51398 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DAP3P51398 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DAP3P51398 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DAP3P51398 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DAP3P51398 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DAP3P51398 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DAP3P51398 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DAP3P51398 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DAP3P51398 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DAP3P51398 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DAP3P51398 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DAP3P51398 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DAP3P51398 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DAP3P51398 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DAP3P51398 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DAP3P51398 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DAP3P51398 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DAP3P51398 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DAP3P51398 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms