Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRIP1P50238 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms