Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRE11P49959 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRE11P49959 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRE11P49959 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRE11P49959 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRE11P49959 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRE11P49959 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRE11P49959 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRE11P49959 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRE11P49959 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRE11P49959 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRE11P49959 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRE11P49959 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRE11P49959 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRE11P49959 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRE11P49959 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRE11P49959 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRE11P49959 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRE11P49959 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MRE11P49959 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRE11P49959 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRE11P49959 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRE11P49959 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRE11P49959 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRE11P49959 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRE11P49959 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRE11P49959 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRE11P49959 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRE11P49959 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRE11P49959 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRE11P49959 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRE11P49959 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRE11P49959 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRE11P49959 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MRE11P49959 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MRE11P49959 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRE11P49959 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRE11P49959 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRE11P49959 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRE11P49959 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRE11P49959 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MRE11P49959 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRE11P49959 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRE11P49959 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRE11P49959 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MRE11P49959 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRE11P49959 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRE11P49959 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRE11P49959 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRE11P49959 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRE11P49959 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRE11P49959 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRE11P49959 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRE11P49959 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRE11P49959 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRE11P49959 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRE11P49959 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRE11P49959 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRE11P49959 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRE11P49959 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRE11P49959 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRE11P49959 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRE11P49959 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRE11P49959 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRE11P49959 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MRE11P49959 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRE11P49959 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRE11P49959 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRE11P49959 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MRE11P49959 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRE11P49959 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRE11P49959 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRE11P49959 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRE11P49959 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRE11P49959 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRE11P49959 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MRE11P49959 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRE11P49959 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRE11P49959 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRE11P49959 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRE11P49959 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRE11P49959 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRE11P49959 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRE11P49959 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRE11P49959 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRE11P49959 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRE11P49959 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRE11P49959 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRE11P49959 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRE11P49959 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRE11P49959 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRE11P49959 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRE11P49959 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRE11P49959 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRE11P49959 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRE11P49959 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRE11P49959 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRE11P49959 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRE11P49959 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRE11P49959 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms