Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNTAP49354 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNTAP49354 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNTAP49354 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNTAP49354 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNTAP49354 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNTAP49354 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNTAP49354 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNTAP49354 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNTAP49354 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNTAP49354 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNTAP49354 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNTAP49354 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNTAP49354 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNTAP49354 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNTAP49354 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNTAP49354 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNTAP49354 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNTAP49354 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FNTAP49354 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNTAP49354 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNTAP49354 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNTAP49354 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNTAP49354 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNTAP49354 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNTAP49354 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNTAP49354 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNTAP49354 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNTAP49354 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNTAP49354 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNTAP49354 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNTAP49354 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNTAP49354 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNTAP49354 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNTAP49354 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNTAP49354 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNTAP49354 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNTAP49354 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNTAP49354 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNTAP49354 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNTAP49354 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNTAP49354 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNTAP49354 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNTAP49354 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNTAP49354 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNTAP49354 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNTAP49354 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNTAP49354 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNTAP49354 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNTAP49354 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNTAP49354 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNTAP49354 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNTAP49354 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNTAP49354 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNTAP49354 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FNTAP49354 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FNTAP49354 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNTAP49354 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNTAP49354 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNTAP49354 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNTAP49354 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNTAP49354 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNTAP49354 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNTAP49354 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNTAP49354 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNTAP49354 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNTAP49354 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNTAP49354 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FNTAP49354 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNTAP49354 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNTAP49354 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNTAP49354 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNTAP49354 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNTAP49354 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNTAP49354 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNTAP49354 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNTAP49354 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTAP49354 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTAP49354 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTAP49354 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTAP49354 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTAP49354 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTAP49354 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTAP49354 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTAP49354 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTAP49354 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTAP49354 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTAP49354 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTAP49354 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTAP49354 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTAP49354 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTAP49354 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTAP49354 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNTAP49354 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNTAP49354 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FNTAP49354 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNTAP49354 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNTAP49354 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNTAP49354 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FNTAP49354 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms