Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNT3P45378 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms