Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PIK3CBP42338 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms