Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN2P35609 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms