Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMI1P35226 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMI1P35226 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BMI1P35226 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMI1P35226 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMI1P35226 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMI1P35226 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMI1P35226 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMI1P35226 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMI1P35226 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMI1P35226 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMI1P35226 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMI1P35226 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMI1P35226 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BMI1P35226 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMI1P35226 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMI1P35226 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMI1P35226 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BMI1P35226 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMI1P35226 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMI1P35226 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMI1P35226 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMI1P35226 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMI1P35226 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMI1P35226 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMI1P35226 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMI1P35226 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMI1P35226 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMI1P35226 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMI1P35226 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMI1P35226 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BMI1P35226 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BMI1P35226 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BMI1P35226 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
BMI1P35226 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BMI1P35226 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BMI1P35226 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BMI1P35226 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BMI1P35226 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BMI1P35226 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BMI1P35226 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BMI1P35226 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BMI1P35226 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BMI1P35226 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BMI1P35226 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BMI1P35226 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BMI1P35226 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BMI1P35226 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BMI1P35226 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BMI1P35226 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BMI1P35226 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BMI1P35226 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BMI1P35226 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BMI1P35226 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BMI1P35226 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BMI1P35226 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BMI1P35226 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BMI1P35226 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BMI1P35226 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BMI1P35226 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BMI1P35226 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BMI1P35226 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BMI1P35226 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BMI1P35226 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BMI1P35226 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BMI1P35226 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BMI1P35226 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BMI1P35226 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BMI1P35226 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BMI1P35226 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BMI1P35226 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BMI1P35226 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BMI1P35226 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BMI1P35226 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BMI1P35226 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BMI1P35226 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BMI1P35226 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BMI1P35226 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BMI1P35226 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BMI1P35226 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BMI1P35226 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BMI1P35226 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BMI1P35226 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BMI1P35226 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BMI1P35226 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BMI1P35226 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BMI1P35226 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BMI1P35226 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BMI1P35226 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BMI1P35226 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BMI1P35226 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BMI1P35226 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BMI1P35226 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BMI1P35226 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BMI1P35226 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BMI1P35226 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BMI1P35226 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BMI1P35226 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BMI1P35226 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BMI1P35226 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms