Protein–RNA interactions for Protein: P32578

SIP1, SNF1 protein kinase subunit beta-1, yeast

Predictions only

Length 815 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIP1	P32578	YNL184C	YNL184C	327 nt		3.44	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	ISM1	YPL040C	3009 nt		3.44	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	LCB5	YLR260W	2064 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	STU1	YBL034C	4542 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	HMLALPHA2	YCL067C	633 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	SRD1	YCR018C	666 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	MATALPHA2	YCR039C	633 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	HTA1	YDR225W	399 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	YDR271C	YDR271C	372 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	SPT2	YER161C	1002 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	YGL108C	YGL108C	423 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	FUR1	YHR128W	651 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	SDL1	YIL167W	633 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	SCD6	YPR129W	1050 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	snR35	snR35	204 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	HDA2	YDR295C	2025 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	FRE4	YNR060W	2160 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	NDC80	YIL144W	2076 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	SLK19	YOR195W	2466 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	YDR262W	YDR262W	819 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	CPR5	YDR304C	678 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	YDR464C-A	YDR464C-A	189 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	YEL075C	YEL075C	369 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	YGR018C	YGR018C	330 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	SPT4	YGR063C	309 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	YIL029C	YIL029C	429 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	YJL007C	YJL007C	315 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	ECM16	YMR128W	3804 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	MRPL44	YMR225C	297 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	MBA1	YBR185C	837 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	SSM4	YIL030C	3960 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	RAD4	YER162C	2265 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	CHL1	YPL008W	2586 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	GCR1	YPL075W	2358 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	AFR1	YDR085C	1863 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	BRE5	YNR051C	1548 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	YCR085W	YCR085W	354 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	ARF1	YDL192W	546 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	YDR199W	YDR199W	366 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	YER175W-A	YER175W-A	165 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	CNN1	YFR046C	1086 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	YGR228W	YGR228W	345 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	CIC1	YHR052W	1131 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	PCL5	YHR071W	690 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	FYV7	YLR068W	456 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	YLR154W-B	YLR154W-B	165 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	ATX1	YNL259C	222 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	GCY1	YOR120W	939 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	ECM23	YPL021W	564 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	YPL107W	YPL107W	747 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	RPC40	YPR110C	1008 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	RNT1	YMR239C	1416 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	APE2	YKL157W	2859 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	DIT2	YDR402C	1470 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	GWT1	YJL091C	1473 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	RSC58	YLR033W	1509 nt		3.4	□□□□□ -1.86
SIP1	P32578	SPR6	YER115C	576 nt		3.4	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	VMA10	YHR039C-A	345 nt		3.4	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	YHR212C	YHR212C	336 nt		3.4	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	RPB3	YIL021W	957 nt		3.4	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	AGE2	YIL044C	897 nt		3.4	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	YIL171W-A	YIL171W-A	453 nt		3.4	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	YJL220W	YJL220W	453 nt		3.4	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	EAF6	YJR082C	342 nt		3.4	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	ACF4	YJR083C	930 nt		3.4	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	SOD1	YJR104C	465 nt		3.4	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	FMP46	YKR049C	402 nt		3.4	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	YAR060C	YAR060C	336 nt		3.4	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	VPS63	YLR261C	327 nt		3.4	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	YLR264C-A	YLR264C-A	117 nt		3.4	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	YLR400W	YLR400W	474 nt		3.4	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	YPL205C	YPL205C	345 nt		3.4	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	TMA108	YIL137C	2841 nt		3.4	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	ETP1	YHL010C	1758 nt		3.4	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	TRM11	YOL124C	1302 nt		3.4	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	YLR352W	YLR352W	2424 nt		3.4	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	PHR1	YOR386W	1698 nt		3.39	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	PHM7	YOL084W	2976 nt		3.39	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	IRC3	YDR332W	2070 nt		3.39	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	MTC4	YBR255W	2085 nt		3.39	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	YCR045W-A	YCR045W-A	351 nt		3.39	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	YDR115W	YDR115W	318 nt		3.39	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	MIG3	YER028C	1185 nt		3.39	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	TDA2	YER071C	381 nt		3.39	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	YHL026C	YHL026C	948 nt		3.39	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	YIL141W	YIL141W	390 nt		3.39	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	EFB1	YAL003W	621 nt		3.39	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	YMR144W	YMR144W	1029 nt		3.39	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	YOL114C	YOL114C	609 nt		3.39	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	SPC29	YPL124W	762 nt		3.39	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	LTP1	YPR073C	486 nt		3.39	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	15S_rRNA	15S_rRNA	1649 nt		3.39	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	PDR12	YPL058C	4536 nt		3.39	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	SYO1	YDL063C	1863 nt		3.39	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	BEM4	YPL161C	1902 nt		3.38	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	RGL1	YPL066W	1440 nt		3.38	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	FLO8	YER109C	2400 nt		3.38	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	YDR089W	YDR089W	2610 nt		3.38	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	SPC19	YDR201W	498 nt		3.38	□□□□□ -1.87
SIP1	P32578	GRX2	YDR513W	432 nt		3.38	□□□□□ -1.87

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