Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA13P31271 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA13P31271 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms