Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXA7P31268 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA7P31268 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms