Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CD40LGP29965 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD40LGP29965 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms