Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP1P29466 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP1P29466 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP1P29466 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP1P29466 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP1P29466 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP1P29466 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP1P29466 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP1P29466 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP1P29466 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP1P29466 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP1P29466 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP1P29466 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP1P29466 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP1P29466 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP1P29466 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP1P29466 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP1P29466 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP1P29466 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP1P29466 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP1P29466 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP1P29466 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP1P29466 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP1P29466 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP1P29466 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP1P29466 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP1P29466 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP1P29466 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP1P29466 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP1P29466 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP1P29466 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP1P29466 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP1P29466 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP1P29466 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP1P29466 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP1P29466 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP1P29466 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP1P29466 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP1P29466 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP1P29466 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP1P29466 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP1P29466 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP1P29466 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP1P29466 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP1P29466 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP1P29466 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP1P29466 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP1P29466 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP1P29466 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP1P29466 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP1P29466 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP1P29466 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP1P29466 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP1P29466 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP1P29466 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP1P29466 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP1P29466 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP1P29466 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP1P29466 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP1P29466 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP1P29466 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP1P29466 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP1P29466 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP1P29466 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP1P29466 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP1P29466 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP1P29466 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP1P29466 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP1P29466 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP1P29466 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP1P29466 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP1P29466 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP1P29466 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP1P29466 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP1P29466 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP1P29466 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP1P29466 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP1P29466 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP1P29466 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP1P29466 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP1P29466 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP1P29466 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP1P29466 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP1P29466 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP1P29466 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP1P29466 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP1P29466 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP1P29466 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP1P29466 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP1P29466 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASP1P29466 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASP1P29466 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASP1P29466 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASP1P29466 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASP1P29466 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP1P29466 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP1P29466 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP1P29466 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP1P29466 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP1P29466 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms