Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB2P29033 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB2P29033 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB2P29033 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB2P29033 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB2P29033 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB2P29033 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB2P29033 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB2P29033 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB2P29033 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB2P29033 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB2P29033 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB2P29033 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB2P29033 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB2P29033 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB2P29033 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB2P29033 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB2P29033 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB2P29033 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB2P29033 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB2P29033 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB2P29033 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB2P29033 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB2P29033 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB2P29033 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB2P29033 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB2P29033 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB2P29033 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB2P29033 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB2P29033 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB2P29033 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB2P29033 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB2P29033 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB2P29033 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB2P29033 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB2P29033 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB2P29033 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB2P29033 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB2P29033 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB2P29033 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB2P29033 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB2P29033 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB2P29033 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB2P29033 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB2P29033 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB2P29033 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB2P29033 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB2P29033 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB2P29033 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB2P29033 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB2P29033 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB2P29033 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB2P29033 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB2P29033 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB2P29033 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB2P29033 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB2P29033 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB2P29033 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB2P29033 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB2P29033 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB2P29033 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB2P29033 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB2P29033 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB2P29033 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB2P29033 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB2P29033 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB2P29033 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB2P29033 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB2P29033 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB2P29033 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB2P29033 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB2P29033 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB2P29033 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB2P29033 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB2P29033 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB2P29033 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB2P29033 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB2P29033 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB2P29033 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB2P29033 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB2P29033 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB2P29033 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB2P29033 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB2P29033 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB2P29033 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB2P29033 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB2P29033 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB2P29033 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB2P29033 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB2P29033 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB2P29033 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB2P29033 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB2P29033 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB2P29033 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB2P29033 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB2P29033 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB2P29033 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB2P29033 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB2P29033 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB2P29033 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms