Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBL1P28749 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBL1P28749 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBL1P28749 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBL1P28749 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBL1P28749 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBL1P28749 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBL1P28749 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBL1P28749 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBL1P28749 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBL1P28749 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBL1P28749 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBL1P28749 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RBL1P28749 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBL1P28749 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBL1P28749 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBL1P28749 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBL1P28749 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBL1P28749 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBL1P28749 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBL1P28749 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBL1P28749 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBL1P28749 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBL1P28749 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBL1P28749 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBL1P28749 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBL1P28749 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBL1P28749 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBL1P28749 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBL1P28749 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBL1P28749 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBL1P28749 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBL1P28749 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBL1P28749 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBL1P28749 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBL1P28749 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBL1P28749 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBL1P28749 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBL1P28749 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBL1P28749 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBL1P28749 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBL1P28749 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBL1P28749 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RBL1P28749 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBL1P28749 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBL1P28749 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBL1P28749 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBL1P28749 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBL1P28749 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBL1P28749 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBL1P28749 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBL1P28749 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBL1P28749 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBL1P28749 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBL1P28749 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBL1P28749 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBL1P28749 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBL1P28749 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBL1P28749 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBL1P28749 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBL1P28749 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBL1P28749 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBL1P28749 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBL1P28749 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBL1P28749 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBL1P28749 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBL1P28749 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBL1P28749 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBL1P28749 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBL1P28749 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBL1P28749 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBL1P28749 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBL1P28749 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBL1P28749 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBL1P28749 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBL1P28749 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBL1P28749 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBL1P28749 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBL1P28749 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBL1P28749 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBL1P28749 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RBL1P28749 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBL1P28749 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBL1P28749 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBL1P28749 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBL1P28749 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBL1P28749 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBL1P28749 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBL1P28749 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RBL1P28749 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBL1P28749 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBL1P28749 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBL1P28749 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBL1P28749 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBL1P28749 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBL1P28749 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBL1P28749 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBL1P28749 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBL1P28749 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBL1P28749 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms