Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIG1P18858 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LIG1P18858 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIG1P18858 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIG1P18858 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIG1P18858 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIG1P18858 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIG1P18858 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIG1P18858 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIG1P18858 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LIG1P18858 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LIG1P18858 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LIG1P18858 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIG1P18858 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIG1P18858 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIG1P18858 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIG1P18858 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIG1P18858 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIG1P18858 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIG1P18858 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIG1P18858 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIG1P18858 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIG1P18858 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIG1P18858 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIG1P18858 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIG1P18858 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIG1P18858 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIG1P18858 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIG1P18858 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIG1P18858 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LIG1P18858 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIG1P18858 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIG1P18858 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIG1P18858 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIG1P18858 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIG1P18858 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIG1P18858 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIG1P18858 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIG1P18858 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIG1P18858 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIG1P18858 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIG1P18858 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIG1P18858 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIG1P18858 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIG1P18858 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIG1P18858 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIG1P18858 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIG1P18858 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIG1P18858 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIG1P18858 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIG1P18858 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIG1P18858 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIG1P18858 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIG1P18858 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIG1P18858 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIG1P18858 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIG1P18858 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIG1P18858 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIG1P18858 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIG1P18858 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIG1P18858 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIG1P18858 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIG1P18858 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIG1P18858 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIG1P18858 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIG1P18858 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LIG1P18858 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIG1P18858 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIG1P18858 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIG1P18858 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIG1P18858 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIG1P18858 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIG1P18858 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIG1P18858 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIG1P18858 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIG1P18858 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIG1P18858 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIG1P18858 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIG1P18858 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIG1P18858 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIG1P18858 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LIG1P18858 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIG1P18858 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIG1P18858 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIG1P18858 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LIG1P18858 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIG1P18858 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIG1P18858 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LIG1P18858 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIG1P18858 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIG1P18858 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIG1P18858 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIG1P18858 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIG1P18858 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIG1P18858 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIG1P18858 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIG1P18858 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LIG1P18858 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LIG1P18858 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LIG1P18858 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms