Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCP1P17987 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCP1P17987 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TCP1P17987 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCP1P17987 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCP1P17987 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCP1P17987 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCP1P17987 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCP1P17987 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCP1P17987 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCP1P17987 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCP1P17987 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TCP1P17987 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCP1P17987 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCP1P17987 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCP1P17987 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCP1P17987 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCP1P17987 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCP1P17987 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCP1P17987 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCP1P17987 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCP1P17987 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCP1P17987 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCP1P17987 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCP1P17987 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCP1P17987 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCP1P17987 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCP1P17987 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCP1P17987 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCP1P17987 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCP1P17987 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCP1P17987 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCP1P17987 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCP1P17987 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCP1P17987 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCP1P17987 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCP1P17987 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TCP1P17987 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TCP1P17987 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCP1P17987 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCP1P17987 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCP1P17987 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCP1P17987 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCP1P17987 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TCP1P17987 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCP1P17987 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCP1P17987 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TCP1P17987 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCP1P17987 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCP1P17987 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCP1P17987 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCP1P17987 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCP1P17987 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCP1P17987 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCP1P17987 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCP1P17987 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCP1P17987 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCP1P17987 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCP1P17987 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCP1P17987 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCP1P17987 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCP1P17987 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCP1P17987 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCP1P17987 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCP1P17987 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCP1P17987 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCP1P17987 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCP1P17987 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCP1P17987 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCP1P17987 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCP1P17987 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCP1P17987 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCP1P17987 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCP1P17987 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCP1P17987 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCP1P17987 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCP1P17987 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCP1P17987 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCP1P17987 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCP1P17987 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCP1P17987 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCP1P17987 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCP1P17987 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCP1P17987 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCP1P17987 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCP1P17987 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCP1P17987 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TCP1P17987 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCP1P17987 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCP1P17987 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCP1P17987 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCP1P17987 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCP1P17987 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TCP1P17987 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCP1P17987 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCP1P17987 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCP1P17987 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCP1P17987 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCP1P17987 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TCP1P17987 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms