Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP2A2P16615 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2A2P16615 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms