Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VEGFAP15692 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VEGFAP15692 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms