Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC5A1P13866 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC5A1P13866 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC5A1P13866 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC5A1P13866 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC5A1P13866 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC5A1P13866 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC5A1P13866 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC5A1P13866 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC5A1P13866 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC5A1P13866 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC5A1P13866 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC5A1P13866 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC5A1P13866 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC5A1P13866 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC5A1P13866 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC5A1P13866 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC5A1P13866 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC5A1P13866 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC5A1P13866 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC5A1P13866 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms