Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SKIP12755 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIP12755 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIP12755 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIP12755 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIP12755 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIP12755 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIP12755 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIP12755 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIP12755 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIP12755 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIP12755 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIP12755 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIP12755 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIP12755 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIP12755 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIP12755 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIP12755 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIP12755 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIP12755 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIP12755 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIP12755 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIP12755 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIP12755 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIP12755 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIP12755 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIP12755 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIP12755 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIP12755 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIP12755 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIP12755 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIP12755 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIP12755 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIP12755 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIP12755 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIP12755 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIP12755 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIP12755 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIP12755 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIP12755 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIP12755 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIP12755 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIP12755 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIP12755 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIP12755 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIP12755 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIP12755 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIP12755 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIP12755 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIP12755 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIP12755 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIP12755 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIP12755 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIP12755 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIP12755 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIP12755 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIP12755 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIP12755 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIP12755 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIP12755 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIP12755 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIP12755 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIP12755 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIP12755 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIP12755 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIP12755 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIP12755 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIP12755 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIP12755 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIP12755 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIP12755 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIP12755 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIP12755 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIP12755 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIP12755 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIP12755 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIP12755 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIP12755 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIP12755 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIP12755 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIP12755 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIP12755 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIP12755 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIP12755 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIP12755 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKIP12755 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIP12755 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIP12755 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIP12755 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIP12755 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIP12755 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIP12755 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIP12755 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIP12755 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIP12755 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIP12755 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIP12755 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIP12755 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKIP12755 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SKIP12755 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms