Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RLBP1P12271 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RLBP1P12271 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RLBP1P12271 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms