Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP2C9P11712 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms