Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM17P0DL12 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms