Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms