Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC175P0C221 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms