Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CENPBP07199 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CENPBP07199 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CENPBP07199 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CENPBP07199 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CENPBP07199 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CENPBP07199 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CENPBP07199 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CENPBP07199 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CENPBP07199 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CENPBP07199 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CENPBP07199 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CENPBP07199 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CENPBP07199 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CENPBP07199 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CENPBP07199 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CENPBP07199 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CENPBP07199 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CENPBP07199 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CENPBP07199 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CENPBP07199 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CENPBP07199 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CENPBP07199 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CENPBP07199 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CENPBP07199 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CENPBP07199 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CENPBP07199 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CENPBP07199 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CENPBP07199 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CENPBP07199 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CENPBP07199 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CENPBP07199 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPBP07199 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPBP07199 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPBP07199 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPBP07199 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPBP07199 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPBP07199 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPBP07199 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPBP07199 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPBP07199 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPBP07199 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPBP07199 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPBP07199 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPBP07199 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPBP07199 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPBP07199 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPBP07199 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPBP07199 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPBP07199 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPBP07199 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPBP07199 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPBP07199 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPBP07199 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPBP07199 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPBP07199 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPBP07199 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPBP07199 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPBP07199 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPBP07199 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPBP07199 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPBP07199 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPBP07199 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPBP07199 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPBP07199 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPBP07199 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPBP07199 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPBP07199 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPBP07199 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPBP07199 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPBP07199 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPBP07199 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPBP07199 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPBP07199 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPBP07199 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPBP07199 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPBP07199 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPBP07199 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPBP07199 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPBP07199 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPBP07199 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPBP07199 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPBP07199 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPBP07199 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPBP07199 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPBP07199 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPBP07199 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPBP07199 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPBP07199 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPBP07199 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPBP07199 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPBP07199 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CENPBP07199 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CENPBP07199 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CENPBP07199 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CENPBP07199 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CENPBP07199 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CENPBP07199 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CENPBP07199 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CENPBP07199 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms