Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HLA-DOAP06340 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms