Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABARAPO95166 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABARAPO95166 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABARAPO95166 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABARAPO95166 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABARAPO95166 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms