Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F6O75461 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F6O75461 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F6O75461 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F6O75461 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F6O75461 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F6O75461 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F6O75461 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F6O75461 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F6O75461 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F6O75461 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F6O75461 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F6O75461 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F6O75461 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F6O75461 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F6O75461 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F6O75461 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F6O75461 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F6O75461 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F6O75461 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F6O75461 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F6O75461 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F6O75461 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F6O75461 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F6O75461 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F6O75461 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F6O75461 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F6O75461 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F6O75461 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F6O75461 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F6O75461 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F6O75461 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F6O75461 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F6O75461 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F6O75461 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F6O75461 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F6O75461 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F6O75461 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F6O75461 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F6O75461 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F6O75461 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F6O75461 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F6O75461 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F6O75461 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F6O75461 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F6O75461 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F6O75461 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F6O75461 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F6O75461 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F6O75461 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F6O75461 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F6O75461 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F6O75461 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F6O75461 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F6O75461 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F6O75461 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F6O75461 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F6O75461 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F6O75461 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F6O75461 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F6O75461 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F6O75461 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F6O75461 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F6O75461 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F6O75461 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F6O75461 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F6O75461 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F6O75461 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F6O75461 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F6O75461 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F6O75461 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F6O75461 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F6O75461 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F6O75461 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F6O75461 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F6O75461 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F6O75461 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F6O75461 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
E2F6O75461 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F6O75461 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F6O75461 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F6O75461 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F6O75461 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F6O75461 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F6O75461 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F6O75461 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F6O75461 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F6O75461 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F6O75461 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F6O75461 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F6O75461 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F6O75461 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F6O75461 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F6O75461 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F6O75461 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F6O75461 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F6O75461 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F6O75461 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
E2F6O75461 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F6O75461 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms