Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRD4O60885 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRD4O60885 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRD4O60885 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRD4O60885 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRD4O60885 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRD4O60885 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRD4O60885 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRD4O60885 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRD4O60885 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRD4O60885 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRD4O60885 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRD4O60885 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRD4O60885 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRD4O60885 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRD4O60885 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRD4O60885 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRD4O60885 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRD4O60885 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRD4O60885 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRD4O60885 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
BRD4O60885 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRD4O60885 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRD4O60885 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRD4O60885 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRD4O60885 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRD4O60885 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRD4O60885 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRD4O60885 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRD4O60885 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRD4O60885 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRD4O60885 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRD4O60885 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRD4O60885 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRD4O60885 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRD4O60885 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
BRD4O60885 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRD4O60885 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRD4O60885 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
BRD4O60885 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
BRD4O60885 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
BRD4O60885 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
BRD4O60885 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
BRD4O60885 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRD4O60885 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRD4O60885 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRD4O60885 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
BRD4O60885 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRD4O60885 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
BRD4O60885 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRD4O60885 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
BRD4O60885 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRD4O60885 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRD4O60885 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
BRD4O60885 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRD4O60885 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRD4O60885 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRD4O60885 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRD4O60885 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRD4O60885 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRD4O60885 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRD4O60885 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRD4O60885 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRD4O60885 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRD4O60885 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRD4O60885 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRD4O60885 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRD4O60885 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRD4O60885 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRD4O60885 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRD4O60885 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRD4O60885 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRD4O60885 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRD4O60885 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRD4O60885 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRD4O60885 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRD4O60885 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRD4O60885 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRD4O60885 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRD4O60885 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRD4O60885 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRD4O60885 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRD4O60885 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRD4O60885 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRD4O60885 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRD4O60885 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRD4O60885 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRD4O60885 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRD4O60885 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRD4O60885 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
BRD4O60885 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRD4O60885 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRD4O60885 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRD4O60885 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRD4O60885 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRD4O60885 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRD4O60885 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRD4O60885 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRD4O60885 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRD4O60885 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms