Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAK2O60296 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms