Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX6O43752 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX6O43752 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX6O43752 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX6O43752 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX6O43752 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX6O43752 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX6O43752 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX6O43752 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX6O43752 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX6O43752 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX6O43752 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX6O43752 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX6O43752 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX6O43752 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
STX6O43752 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX6O43752 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX6O43752 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX6O43752 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX6O43752 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX6O43752 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX6O43752 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX6O43752 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX6O43752 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX6O43752 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX6O43752 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX6O43752 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX6O43752 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX6O43752 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX6O43752 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX6O43752 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX6O43752 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX6O43752 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX6O43752 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX6O43752 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX6O43752 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX6O43752 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX6O43752 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX6O43752 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX6O43752 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX6O43752 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX6O43752 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX6O43752 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
STX6O43752 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX6O43752 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX6O43752 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX6O43752 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX6O43752 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX6O43752 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX6O43752 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX6O43752 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX6O43752 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX6O43752 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX6O43752 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX6O43752 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX6O43752 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
STX6O43752 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX6O43752 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
STX6O43752 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX6O43752 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX6O43752 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX6O43752 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX6O43752 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX6O43752 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX6O43752 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
STX6O43752 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX6O43752 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STX6O43752 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STX6O43752 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
STX6O43752 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STX6O43752 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STX6O43752 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
STX6O43752 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STX6O43752 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STX6O43752 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STX6O43752 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STX6O43752 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STX6O43752 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STX6O43752 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STX6O43752 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STX6O43752 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STX6O43752 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STX6O43752 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STX6O43752 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STX6O43752 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STX6O43752 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STX6O43752 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STX6O43752 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STX6O43752 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STX6O43752 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STX6O43752 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STX6O43752 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STX6O43752 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STX6O43752 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STX6O43752 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX6O43752 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX6O43752 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX6O43752 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
STX6O43752 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX6O43752 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms