Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRC1O43663 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRC1O43663 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRC1O43663 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRC1O43663 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRC1O43663 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRC1O43663 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRC1O43663 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRC1O43663 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRC1O43663 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRC1O43663 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRC1O43663 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRC1O43663 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRC1O43663 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRC1O43663 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRC1O43663 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRC1O43663 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRC1O43663 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRC1O43663 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRC1O43663 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRC1O43663 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRC1O43663 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRC1O43663 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRC1O43663 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRC1O43663 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRC1O43663 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRC1O43663 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRC1O43663 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRC1O43663 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRC1O43663 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRC1O43663 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRC1O43663 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRC1O43663 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRC1O43663 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRC1O43663 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRC1O43663 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRC1O43663 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRC1O43663 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRC1O43663 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRC1O43663 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRC1O43663 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRC1O43663 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRC1O43663 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRC1O43663 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRC1O43663 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRC1O43663 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRC1O43663 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRC1O43663 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRC1O43663 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRC1O43663 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRC1O43663 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRC1O43663 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRC1O43663 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRC1O43663 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRC1O43663 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRC1O43663 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRC1O43663 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRC1O43663 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRC1O43663 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRC1O43663 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRC1O43663 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRC1O43663 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRC1O43663 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRC1O43663 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRC1O43663 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRC1O43663 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRC1O43663 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRC1O43663 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRC1O43663 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRC1O43663 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRC1O43663 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRC1O43663 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRC1O43663 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRC1O43663 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRC1O43663 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRC1O43663 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRC1O43663 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRC1O43663 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRC1O43663 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRC1O43663 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRC1O43663 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRC1O43663 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRC1O43663 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRC1O43663 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRC1O43663 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRC1O43663 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRC1O43663 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRC1O43663 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRC1O43663 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRC1O43663 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRC1O43663 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRC1O43663 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRC1O43663 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRC1O43663 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRC1O43663 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRC1O43663 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRC1O43663 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRC1O43663 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRC1O43663 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRC1O43663 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms