Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DENRO43583 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DENRO43583 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DENRO43583 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DENRO43583 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DENRO43583 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DENRO43583 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DENRO43583 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DENRO43583 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DENRO43583 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DENRO43583 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DENRO43583 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DENRO43583 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DENRO43583 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DENRO43583 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DENRO43583 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DENRO43583 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DENRO43583 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DENRO43583 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DENRO43583 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DENRO43583 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DENRO43583 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DENRO43583 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DENRO43583 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DENRO43583 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DENRO43583 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DENRO43583 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DENRO43583 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DENRO43583 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DENRO43583 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DENRO43583 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DENRO43583 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DENRO43583 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DENRO43583 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DENRO43583 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DENRO43583 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DENRO43583 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DENRO43583 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DENRO43583 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
DENRO43583 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DENRO43583 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DENRO43583 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DENRO43583 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DENRO43583 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
DENRO43583 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
DENRO43583 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DENRO43583 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DENRO43583 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DENRO43583 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DENRO43583 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DENRO43583 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DENRO43583 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DENRO43583 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DENRO43583 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DENRO43583 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DENRO43583 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DENRO43583 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DENRO43583 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
DENRO43583 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DENRO43583 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DENRO43583 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DENRO43583 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DENRO43583 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DENRO43583 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DENRO43583 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DENRO43583 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DENRO43583 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DENRO43583 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DENRO43583 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DENRO43583 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DENRO43583 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
DENRO43583 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DENRO43583 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DENRO43583 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DENRO43583 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DENRO43583 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DENRO43583 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DENRO43583 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DENRO43583 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DENRO43583 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DENRO43583 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DENRO43583 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DENRO43583 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DENRO43583 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DENRO43583 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DENRO43583 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DENRO43583 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DENRO43583 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DENRO43583 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DENRO43583 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DENRO43583 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DENRO43583 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DENRO43583 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DENRO43583 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DENRO43583 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
DENRO43583 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
DENRO43583 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DENRO43583 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DENRO43583 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DENRO43583 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms