Protein–RNA interactions for Protein: O43252

PAPSS1, Bifunctional 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPSS1O43252 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPSS1O43252 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPSS1O43252 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms