Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms