Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD28O15084 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD28O15084 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms