Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IKBKBO14920 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms