Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms