Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BQV1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BQV1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BQV1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BQV1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BQV1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BQV1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BQV1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BQV1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BQV1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BQV1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BQV1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BQV1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BQV1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BQV1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BQV1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BQV1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BQV1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BQV1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BQV1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
H3BQV1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H3BQV1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H3BQV1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H3BQV1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H3BQV1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H3BQV1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H3BQV1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H3BQV1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H3BQV1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H3BQV1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H3BQV1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BQV1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BQV1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BQV1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BQV1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BQV1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BQV1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BQV1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BQV1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BQV1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BQV1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BQV1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BQV1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BQV1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BQV1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BQV1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BQV1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BQV1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BQV1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BQV1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BQV1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BQV1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BQV1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BQV1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BQV1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BQV1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BQV1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BQV1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BQV1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BQV1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BQV1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BQV1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BQV1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BQV1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BQV1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BQV1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BQV1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BQV1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BQV1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BQV1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BQV1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BQV1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BQV1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BQV1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BQV1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BQV1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BQV1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BQV1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BQV1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BQV1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BQV1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BQV1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BQV1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BQV1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BQV1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BQV1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BQV1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BQV1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BQV1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BQV1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BQV1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BQV1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BQV1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BQV1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BQV1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BQV1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BQV1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BQV1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BQV1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BQV1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms