Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HIGD1CA8MV81 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HIGD1CA8MV81 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HIGD1CA8MV81 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HIGD1CA8MV81 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD1CA8MV81 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD1CA8MV81 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD1CA8MV81 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD1CA8MV81 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD1CA8MV81 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD1CA8MV81 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD1CA8MV81 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD1CA8MV81 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms