Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms