Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6U3

SCIN, Adseverin, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCINQ9Y6U3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCINQ9Y6U3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCINQ9Y6U3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCINQ9Y6U3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCINQ9Y6U3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCINQ9Y6U3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCINQ9Y6U3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCINQ9Y6U3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCINQ9Y6U3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCINQ9Y6U3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SCINQ9Y6U3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCINQ9Y6U3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCINQ9Y6U3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCINQ9Y6U3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCINQ9Y6U3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCINQ9Y6U3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCINQ9Y6U3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCINQ9Y6U3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCINQ9Y6U3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCINQ9Y6U3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCINQ9Y6U3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCINQ9Y6U3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCINQ9Y6U3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCINQ9Y6U3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCINQ9Y6U3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCINQ9Y6U3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCINQ9Y6U3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCINQ9Y6U3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCINQ9Y6U3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCINQ9Y6U3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCINQ9Y6U3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCINQ9Y6U3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms