Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y696

CLIC4, Chloride intracellular channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC4Q9Y696 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLIC4Q9Y696 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLIC4Q9Y696 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLIC4Q9Y696 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLIC4Q9Y696 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC4Q9Y696 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC4Q9Y696 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC4Q9Y696 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC4Q9Y696 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC4Q9Y696 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC4Q9Y696 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC4Q9Y696 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC4Q9Y696 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC4Q9Y696 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC4Q9Y696 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC4Q9Y696 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLIC4Q9Y696 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLIC4Q9Y696 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLIC4Q9Y696 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLIC4Q9Y696 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLIC4Q9Y696 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLIC4Q9Y696 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLIC4Q9Y696 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLIC4Q9Y696 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLIC4Q9Y696 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLIC4Q9Y696 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLIC4Q9Y696 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC4Q9Y696 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms