Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNX13Q9Y5W8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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SNX13Q9Y5W8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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SNX13Q9Y5W8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX13Q9Y5W8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX13Q9Y5W8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX13Q9Y5W8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX13Q9Y5W8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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SNX13Q9Y5W8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX13Q9Y5W8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX13Q9Y5W8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX13Q9Y5W8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX13Q9Y5W8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX13Q9Y5W8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX13Q9Y5W8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX13Q9Y5W8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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